La oncocercosis en Brasil afecta a la población indígena Yanomami que habita un territorio de aproximadamente 90,000 Km², en los estados de Roraima y Amazonas, fronterizos con Venezuela. Este foco se extiende a través de la frontera de Brasil y Venezuela pues los Yanomami de ambos países  mantienen estrechas relaciones y atraviesan la frontera con frecuencia. El programa de tratamiento masivo con Mectizán, en Brasil, se inició en 1995.

En el lado brasileño, la población indígena Yanomami afectada por la enfermedad se ha distribuido en Polos Base que reciben atención en salud por parte de la Fundación Nacional de Salud, a través de convenios con el Ministerio de Salud.  Áreas de difícil acceso de la selva de Amazonas, hace especialmente difícil el tratamiento en este lugar.